Los protestantes aseguran que la Junta de Transición Universitaria no ha cumplido el objetivo para el cual fue creada ya que según dijeron las decisiones tomadas han sido débiles y poco coherentes.
Trabajadores agrupados en el sindicato universitario han dirigido un accionar tendiente a oponerse a las políticas que emanan desde la Comisión de Transición.
Durante sus funciones la junta universitaria ha impulsado una nueva dinámica en el proceso de matricula y un sistema de admisión que responde a estándares de educación superior de universidades de primer nivel.
La Comisión de Transición de la UNAH concluye sus funciones en mayo de este año cuando deberá quedar instalado el nuevo gobierno universitario.