Cojulún, juez de Instancia Penal, había ligado a Maldonado a proceso judicial en octubre de 2013, tras una investigación del Ministerio Público (MP).
La Corte Suprema de Justicia le retiró en diciembre de 2012 la inmunidad que le correspondía a Maldonado como diputada, al tomar en cuenta las pruebas en su contra.
Maldonado supuestamente cometió el delito de peculado, al apropiarse de una donación de la Unión Europea a Guatemala, que debía utilizarse en proyectos para la juventud.
El MP presentó como prueba en contra de la funcionaria un conjunto de cheques a nombre de Sandra Mazariegos, madre de Maldonado.
La diputada dijo hoy a periodistas que es «inocente» y que las acusaciones se deben a una «persecución política».
Maldonado pertenece al partido Lider, principal bancada de oposición en el Parlamento guatemalteco.