Ubicado en un espacio alejado de las plazas centrales de la universidad estatal se encuentra el Museo de Historia Natural de la UNAH, sitio que alberga el pasado y presente de la evolución de la fauna hondureña y de una parte del mundo y que es lugar de visita obligada para todos los investigadores y miembros de la comunidad científica del país por su valioso tesoro que almacena en materia del saber natural del país.